У избирателя есть временная регистрация по месту голосования, постоянной прописки нет вообще. В участковой избирательной комиссии по месту временной регистрации отказывают в выдаче бюллетеня.

В данном случае избирательная комиссия незаконно отказала избирателю.
Конституционный суд Российской Федерации разъяснил (Определение КС РФ от 08.12.2011 №1794-0-0, п.4), что граждане РФ, не имеющие постоянной прописки, могут голосовать по месту временной регистрации.